L'auditeur interne travaille généralement pour de grandes entreprises dans divers secteurs comme l'industrie, la banque ou les services, employant plus de 1 000 personnes. Il arrive que certaines entreprises fassent appel à des cabinets de conseil externes pour leur audit interne, mais la plupart du temps, l'auditeur interne dépend de la direction générale. Ses missions le conduisent à se rendre au siège social, mais aussi dans les sites de production et les filiales de l'entreprise, ce qui le contraint à beaucoup voyager. Dans les groupes qui opèrent à l'international, il est souvent amené à prendre l'avion et à s'adapter aux différentes cultures et pratiques locales. Il n'est pas rare de voir une équipe d'audit composée de 2 à 5 membres de différents niveaux d'expérience et de responsabilités, tels qu'un assistant, un auditeur chevronné et un chef de mission. Ces membres doivent collaborer efficacement, évaluer rapidement la situation et rédiger des rapports pertinents sans perturber le fonctionnement quotidien de l'entreprise ou du service contrôlé.